Podstawowe pojęcia genetyki i biologii molekularnej - plan wykładów:
Semestr I
Wykład 2:Metody i strategie genetyki i genomiki.
Wykład 3:Biologia syntetyczna. Mutacje w ujęciu genetycznym. Interakcje genetyczne 1.
Wykład 4: Interakcje genetyczne 2 - interaktomika. Podstawy genetyki molekularnej 1. Replikacja.
Wykład 5: Podstawy genetyki molekularnej 2. Mutageneza, naprawa DNA .Rekombinacja.
Wykład 6: Ekspresja genu. Przełączniki genetytczne i podstawy genetyki rozwoju i różnicowania.
Wykład 7: Genetyczne podstawy ewolucji. Ewolucja genomów i genów.
Animacja przedstawiająca mechanizm replikacji
Animacje przedstawiające mechanizm translacji
Konwersatoria:
Materiały dodatkowe:
Strona prezentująca podstawowe koncepcje genetyki w przystępnej formie.
Popularny artykuł (P. Golik) o problemie nadmiaru danych podejściu systemowym w biologii.
Modern Statistics for Modern Biology - podręcznik wersja online
Dla zainteresowanych biologią syntetyczną i modyfikowaniem kodu genetycznego:
- Lajoie, M.J., et al., 2013. Genomically recoded organisms expand biological functions. Science 342, 357–360.
- Wang, K., et al., 2012. Reprogramming the genetic code: from triplet to quadruplet codes. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 51, 2288–2297.
- Davis, L., Chin, J.W., 2012. Designer proteins: applications of genetic code expansion in cell biology. Nat Rev Mol Cell Biol 13, 168–182.
- Isaacs, F.J., et al, 2011. Precise Manipulation of Chromosomes in Vivo Enables Genome-Wide Codon Replacement. Science 333, 348–353.
- Neumann, H.,et al., 2010. Encoding multiple unnatural amino acids via evolution of a quadruplet-decoding ribosome. Nature 464, 441–444.
-
Klasyczna publikacja o teście Lurii-Delbrücka ze współczesnym komentarzem:
Luria, S. E., M. Delbrück, 1943, Mutations of bacteria from virus sensitivity to virus resistance. Genetics 28: 491–511.
O teście fluktuacyjnym (w tym modele matematyczne):
RS Robeva, JR Jungck, 2023, Fascination with Fluctuation: Luria and Delbrück’s Legacy.
Artykuł o historii pojęcia "epistaza":
P.C. Philips, 1989,The Language of Gene Interaction, Genetics 149: 1167–1171.
Artykuł o epistazie:
Roth, F.P., Lipshitz, H.D., Andrews B.J., 2009, Q&A: Epistasis, Journal of Biology 8:35.
Artykuł przeglądowy o współczesnych metodach badania interakcji genetycznych:
Boone, C., Bussey, H., Andrews, B.J., 2007, Exploring genetic interactions and networks with yeast, Nat. Rev. Genet. 8: 437-449.
Książka A.-L. Barabási - "Network science"
P. Hunter - "Understanding redundancy and resilience" EMBO Reports (2022) 23: e54742
Program do symulacji genetyki populacji.
Semestr II
Wykład 1: Podstawy genetyki człowieka 1.
Wykład 2: Podstawy genetyki człowieka 2. Zaburzenia chromosomowe.
Wykład 3: Cechy wieloczynnikowe - GWAS, asocjacje, wielogenowe współczynniki ryzyka.
Wykład 4: Genetyczne podstawy nowotworów.
Wykład 5: Paleogenomika.